Estes são os passos para fechar seu arquivo corretamente antes da impressão, no formato PDF-X1a:
1. Com o arquivo aberto e aprovado, vá ao menu Arquivo (File) e escolha a opção Exportar (Export).
2. Escolha o local onde deseja salvar se arquivo e dê um nome a ele. Clique em Salvar.
Abrirá uma tela como a da imagem da próxima página. Nessa janela, em Predefinições de Adobe PDF (Preset), selecione no menu a opção PDF/x-1A 2001. No Padrão (Standard), coloque PDF/x-1A.2001 também.
No painel Páginas (Pages), deixe marcadas as opções Todas e Páginas, no painel Opções (Options) no campo Exportar camadas (Export layers) deixe a opção Camadas visíveis e imprimíveis (Visible & Printable Layers), no painel Include não mude nada.
Após seguir todos estes passos, clique em Exportar (Export).